По итогам работы в 2005 году реорганизованная Харьковская таможня оказалась самой прибыльной среди всех таможен региона.
Прошел год с тех пор, как Восточная региональная таможня приказала долго жить (по приказу руководства Гостаможслужбы Украины) и превратилась в несколько отдельных структур. Как выяснилось, переформатирование не только не ухудшило показатели, но и, наоборот, добавило зачетных очков правопреемнику ВРТ — Харьковской таможне. Даже несмотря на то, что это подразделение является внутренней таможней, а выход на международную арену имеет лишь через Харьковский аэропорт.Тем не менее в 2005 году Харьковская таможня перечислила в государственный бюджет 1,145 млрд. грн. (миллиард «перешагнули» еще в октябре). Поступления увеличились практически по всем статьям: по НДС (на 38%), по акцизному сбору (на 29%), по пошлине (на 26%), по таможенным сборам (на 19%). По информации начальника Харьковской таможни Михаила Прудникова, возрастание цифры поступлений произошло за счет увеличения объемов товарооборота.
Для сравнения эффективности разных таможен, образованных «на руинах» Восточной региональной, интересным является такой показатель, как затраты и доходы. Так вот, на каждую гривну, которая тратится на функционирование Харьковской таможни, ее сотрудники приносят взамен 63 грн. дохода. Остальные выходцы из ВРТ даже в сравнение не идут: Сумская таможня — 11 грн., Купянская таможня — 3,30 грн., Глуховская таможня — 2,80 грн. Если взять ситуацию по стране в целом, то среди всех 49 подразделений Государственной таможенной службы Украины Харьковская таможня занимает шестое место.