Биржа была создана в соответствии с Постановлением Кабинета министров Украины от 26 декабря 2005 г. № 1285. Теперь все закупки сельхозпродукции, а также ценовые интервенции государство в лице Аграрного фонда будет осуществлять на Аграрной бирже.
23 августа 2006 года в Харьковском отделении Аграрной биржи было заключено первое биржевое соглашение, согласно которому продано 470,6 тонны пшеницы мягкой 3-го класса по цене 700 грн. за тонну.
Сейчас в Харьковском регионе активно идет процесс аккредитации брокерских структур в качестве членов Аграрной биржи. Планируется к аккредитации 30-40 предприятий разной формы собственности.
Для участия в биржевых торгах агропромышленные предприятия могут представить заявки на продажу или закупку продукции с помощью брокера.
Биржевые соглашения заключаются ежедневно.